Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
HMGB1P1B2RPK0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms