Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIT1Q9Y2X7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms