Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNAJB4Q9UDY4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJB4Q9UDY4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms