Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms