Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms