Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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