Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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