Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNTNAP3Q9BZ76 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNTNAP3Q9BZ76 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNTNAP3Q9BZ76 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNTNAP3Q9BZ76 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNTNAP3Q9BZ76 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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CNTNAP3Q9BZ76 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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