Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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