Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FYCO1Q9BQS8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FYCO1Q9BQS8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms