Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT140Q96RY7 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms