Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms