Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms