Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
GCSAMQ8N6F7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms