Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC009084.2-201ENST00000624046 2810 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FOXD4Q12950 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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