Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.2 ms