Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SSBP1Q04837 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms