Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms