Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms