Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
POLR2KP53803 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms