Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms