Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA3P32297 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA3P32297 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA3P32297 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms