Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SDSP20132 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SDSP20132 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SDSP20132 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SDSP20132 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms