Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VTNP04004 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VTNP04004 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VTNP04004 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms