Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms