Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms