Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SMIM3Q9BZL3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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