Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ZNF479Q96JC4 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms