Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms