Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A14-202ENST00000448498 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 Z95114.4-201ENST00000623420 3578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP52-201ENST00000352665 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BOLA2-SMG1P6-201ENST00000565417 3103 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF391-201ENST00000244576 4079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms