Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms