Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CUL3Q13618 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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