Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A2Q12908 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms