Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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FAM3AP98173 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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