Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TPTEP56180 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TPTEP56180 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TPTEP56180 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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