Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIRAP54198 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms