Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms