Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MLH1P40692 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MLH1P40692 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms