Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms