Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF4P18085 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF4P18085 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms