Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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