Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM228BP0C875 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms