Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBQ1P09105 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms