Protein–RNA interactions for Protein: P01700

IGLV1-47, Immunoglobulin lambda variable 1-47, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV1-47P01700 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
IGLV1-47P01700 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
IGLV1-47P01700 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms