Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CREB3O43889 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CREB3O43889 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CREB3O43889 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CREB3O43889 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB3O43889 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB3O43889 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB3O43889 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB3O43889 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CREB3O43889 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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