Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms