Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHF24Q9UPV7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms