Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms