Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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