Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP28Q9P2N2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms